W powszechnej świadomości funkcjonują liczne przywileje wynikające ze statusu organizacji pożytku publicznego. Dla pełnego obrazu, warto pochylić się także nad obowiązkami, z jakimi wiążę się dla organizacji pozyskanie statusu OPP.
Po pozyskaniu statusu organizacji pożytku publicznego organizacja ma obowiązek sporządzania rocznego sprawozdania finansowego w części podstawowej (dla organizacji o przychodzie powyżej 100 tys. zł) lub w części uproszczonej (dla organizacji, które osiągnęły przychód do 100 tys. zł). Po zatwierdzeniu sprawozdania finansowego, organizacje pożytku publicznego publikują je wraz ze sprawozdaniami merytorycznymi w internecie. Do 15 lipca organizacje, których rok obrotowy jest zbieżny z rokiem kalendarzowym oraz do 30 listopada organizacje, których rok obrotowy różni się od roku kalendarzowego.
W sytuacji, gdy organizacja pożytku publicznego prześle niepełne sprawozdanie merytoryczne lub finansowe, albo w ogóle ot nie prześlę, to w konsekwencji nie zostanie zamieszczona w wykazie organizacji pożytku publicznego, uprawnionych do otrzymywania 1% podatku za dany rok.
W zakresie prowadzenia księgowości organizacje pożytku publicznego muszą pamiętać o wydzieleniu rachunkowo środków finansowym pozyskanych za sprawą 1% podatku dochodowego od osób fizycznych.